Kendilerine yeni bir yuva arayan son uzaylılar, 1982 yılında Dünya’ya iniş yapar. Uzayın karanlık köşelerinden kaçarak Güney Afrika’nın sessiz bir bölgesine yerleşen bu varlıklar, huzur içinde yaşamayı umarlar. Ancak, MNU adlı açgözlü bir şirketin dikkatini çekerler ve bu huzur kısa sürer. Şirket, uzaylıların sahip olduğu ileri teknolojiyi ele geçirmek için onları District 9 adlı kapalı bir bölgeye hapseder. Şirketin bu karanlık planları, Wikus van der Merwe adlı bir çalışanın gizemli bir virüse maruz kalmasıyla altüst olur. Merwe, yavaş yavaş bir uzaylıya dönüşürken, MNU’nun yeni hedefi haline gelir. Şirketin elinden kurtulmak için District 9’a sığınan Merwe, burada hem insanlık hem de uzaylılar için yeni bir savaşın ortasında bulur kendini. Onun mücadelesi, insanlığın vicdanını sorgulamasına neden olacak ve iki dünya arasında yeni bir düzenin oluşmasına yol açacaktır.